Un fatídico día, toda la humanidad quedó petrificada por un destello de luz cegadora. Después de varios milenios, el estudiante de secundaria Taiju se despierta y se encuentra perdido en un mundo de estatuas.
Sin embargo, no está solo! Su amigo amante de la ciencia, Senku, ha estado funcionando durante algunos meses y tiene un gran plan en mente: ¡poner en marcha la civilización con el poder de la ciencia!
Taiju y Senku comienzan a reconstruir la civilización utilizando el conocimiento científico de Senku. Crean nital; Un solvente corrosivo que destruye la cubierta de piedra en las personas.
Al principio, planean liberar a Yuzuriha, pero cuando los dos son atacados por leones que se han escapado de los zoológicos y se criaron en Japón a lo largo de los siglos, en su lugar liberan a alguien que Taiju reconoce como Tsukasa Shishio, "The Strongest Primate High Schooler", que usa su fuerza para matar a los leones.
Más tarde, también hacen más liquido vital para liberar a Yuzuriha, pero Senku descubre que durante la infancia de Tsukasa fue golpeado brutalmente por un adulto mientras recolectaba conchas marinas para su hermana que se sometía a cirugía; debido a que el hombre creía que tenía los derechos de pesca para la región, Tsukasa estaba robando las conchas marinas.
Dando así a Tsukasa una mentalidad de que solo las "personas de corazón joven puro" deberían revivirse, y así Tsukasa comienza a destruir a los adultos petrificados.
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