La acción transcurre en un plano temporal futurista, en el año 2144 aproximadamente, donde la Tierra ha sido devastada por unos seres llamados Festum desde el año 2114
Por ciertos eventos causados por estos seres los japoneses perdieron su fertilidad y fueron prácticamente borrados del mapa
Los supervivientes se encuentran ahora en una remota isla japonesa llamada Tatsumiya
La gente ha logrado sobrevivir escondiéndose de los Festums usando la más avanzada tecnología
Es el último paraíso en la Tierra
Lo más sorprendente de esta isla es que es todo un continente flotante
Al fin, los Festums descubren la isla y comienzan a atacar
Aún así, los humanos no estaban desprevenidos
Tras activar los escudos de energía que protegen la isla, mandan a un joven piloto, Kazuki Makabe (???? Makabe Kazuki), a luchar contra los Festums usando un robot gigante llamado Fafner.
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