Hace seis meses, Lord Hugh Anthony Disward, también conocido como Huey, perdió a su abuelo excéntrico, Sir Wesley Disward, quien era un reconocido coleccionista de libros raros. La voluntad de su abuelo establece que, para heredar su mansión y todo lo que contiene, debe tomar la tutela de la Bibliotheca Mystica de Dantalian, un archivo que contiene conocimientos prohibidos, y también cuidar de una misteriosa niña llamada Dalian.
Cuando Huey se instala en la mansión, un viejo rival de su abuelo organiza una reunión con él. Dalian, sabiendo que el rival es el asesino de Wesley, lo acompaña y descubre que el asesino está en posesión de un Libro Fantasma, un tomo maldito que Wesley trató de sellar.
Cuando el libro pone a los dos en peligro, Huey descubre que la Bibliotheca Mystica de Dantalian y Dalian son una y la misma, y ??ella le confía la clave para desbloquear los conocimientos almacenados en ella. Juntos, Dalian y Huey sellan el libro, y así comienza una asociación poco probable a medida que resuelven misterios causados ??por otros Libros Fantasma.
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