La historia nos situa en la isla de Iwado, Okinawa, donde ha surgido un movimiento que aboga por el retorno a un gobierno autónomo
Ao Fukai, un chico de 13 años de edad cuyo padre está en paradero desconocido, vive en la isla con el viejo doctor Toshio y está a punto de entrar en la escuela media
La madre de Ao fue secuestrada años atrás por unos individuos desconocidos
Naru Arata, amiga de la infancia de la misma edad que Ao será la heroína de la historia, vive con su padre, su hermano mayor y su abuela
Dispone del poder ?Yuta?, despertado a causa de un accidente cuando era joven
Una misteriosa entidad llamada ?Secret? aparecerá y atacará a los Scub Coral, forma de vida primigenia de la isla
Ao pilota un FP de los militares llamado ?Nirvash?, y lo hará con el firme propósito de proteger la isla
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