Ciudad del Vaticano, Tierra Santa de los católicos. En medio de la tierra, hay una organización que lleva a cabo investigaciones rigurosas sobre "reclamos de milagros" de todo el mundo para determinar su credibilidad. La organización es conocida como "Seito no Za" (Asamblea de Santos) y los sacerdotes que pertenecen a ella son llamados investigadores de milagros.
Robert Nicholas, un antiguo experto en archivos y criptoanálisis está asociado y es buen amigo de Hiraga Josef Kou, un científico genial. Juntos, el brillante dúo investiga los "milagros" y descubre los incidentes y conspiraciones que se esconden tras ellos.
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